كان الإمام (عليه السلام) إذا فرغ من صلاة المغرب ناجى الله تعالى بهذا الدعاء الجليل :

اللهمّ تقبّل منّي ما كان صالحا وأصلح منّي ما كان فاسدا , اللهمّ لا تسلّطني على فساد ما أصلحت منّي وأصلح لي ما أفسدته من نفسي , اللهمّ إنّي أستغفرك من كلّ ذنب قوي عليه بدني بعافيتك ونالته يدي بفضل نعمتك وبسطت إليه يدي بسعة رزقك واحتجبت فيه عن النّاس بسترك واتّكلت فيه على كريم عفوك , اللهمّ إنّي أستغفرك من كلّ ذنب تبت إليك منه وندمت على فعله واستحييت منك وأنا عليه ورهبتك وأنا فيه ثمّ راجعته وعدت إليه , اللهمّ إنّي أستغفرك من كلّ ذنب علمته أو جهلته ذكرته أو نسيته أخطأته أو تعمّدته هو ممّا لا أشكّ أنّ نفسي مرتهنة به وإن كنت نسيته وغفلت عنه , اللهمّ إنّي أستغفرك من كلّ ذنب جنيته على نفسي بيدي وآثرت فيه شهوتي أو سعيت فيه لغيري أو استغويت فيه من تابعني أو كابرت فيه من منعني أو قهرته بجهلي أو لطفت فيه بحيلة غيري أو استزلّني إليه ميلي وهواي , اللهمّ إنّي أستغفرك من كلّ شيء أردت به وجهك فخالطني فيه ما ليس لك وشاركني فيه ما لم يخلص لك وأستغفرك ممّا عقدته على نفسي ثمّ خالفه هواي ؛ اللهمّ صلّ على محمّد وآل محمّد وأعتقني من النّار وجد عليّ بفضلك , اللهمّ إنّي أسألك بوجهك الكريم الباقي الدّائم الّذي أشرقت بنوره السّماوات والأرض وكشفت به ظلمات البرّ والبحر ودبّرت به امور الجنّ والإنس أن تصلّي على محمّد وآل محمّد وأن تصلح شأني برحمتك يا أرحم الرّاحمين .

وحكى هذا الدعاء مدى تمسّك الإمام بالله ومعرفته به وأنّه زعيم الموحّدين وسيّد المتّقين , وكان من دعائه (عليه السلام) عقيب صلاة المغرب هذا الدعاء الموجز :

الحمد لله الّذي يولج اللّيل في النّهار ويولج النّهار في اللّيل الحمد لله كلّما وقب ليل وغسق والحمد لله كلّما لاح نجم وخفق .