تقريبا كل التفاعلات الانزيمية تحتاج الى درجة من التحفيز الحامضي - القاعدي وهناك نوعين من التحفيز الحامضي - القاعدي هما التحفيز الحامضي - القاعدي العام الذي فيه الحامض او القاعدة عدا OH-,+ تعجل التفاعل والتحفيز الحامضي - القاعدي الخاص الذي فيه - تعجل التفاعل، ففي التحفيز الحامضي او القاعدي الخاص فتركيز المحلول المنظم لا يؤثر على التفاعل بينما في تحفيز الحامض - القاعدة العام فأن المحلول المنظم يهب أو يقبل بروتون في الحالة الانتقالية مما يؤثر على سرعة التفاعل الكيمياوي ويمكن القول بأن تحفيز الحامض - القاعدة العام هو تحفيز الذي فيه البروتون ينتقل في الحالة الانتقالية ويمكن توضيح التحلل المائي لمركب p- nitrophenyl acetate مع الاميدازول الذي يعمل كقاعدة عامة، فأن نقل البروتون يثبت الحالة الانتقالية والماء يكون أكثر باحث عن النواة بدون توليد تركيز عالي من ايون الهيدروكسيل او بدون تكوين جنس عالي الطاقة غير ثابت فالتحفيز الحامضي او القاعدي العام يزيد من سرعة التفاعل الكيمياوي بمقدار 10 الى 100 ضعف، المجاميع المتاينه في الانزيم على البروتين تجهز ايون الهيدروجين المنقول في الحالة الانتقالية وتكون المجاميع المتاينه أكثر فعالية من ايون الهيدروجين الذي ينقل العامل قريب من ثابت التفكك لان ثابت تفكك الهستدين قريب من 7 مما يكون الهستدين أكثر فعالية عندما يكون قاعدة او حامض عام، يجهز الموقع الفعال للأنزيم مجاميع R من الاحماض الامينية معينة الذي تكون واهبات بروتون جيدة او قابلات بروتون جيدة، بعض المجاميع القاعدية الحامضية العامة تكون ذات قوة تحفيزية قوية لعدد من التفاعلات العضوية في الانظمة السائلة، مجاميع واهبة لبروتون.

-COOH, SH, NH3 مجاميع قابلة للإلكترون -COO, -NH₂, -S تتمكن الحوامض من تحفيز التفاعلات العضوية بأنها تهب بروتون بصورة مؤقته بينما تتمكن القواعد من ذلك بانها تأخذ بروتون بصورة مؤقتة فالقاعدة تتمكن من تحفيز تحليل الاستر لأنها تجعل الحالة الانتقالية مستقرة وتتمكن ايضا من زيادة سرعة التفاعلات الكيمياوية من خلال زيادة النيكلوفيلية للمجاميع المهاجمة فأن ايونات الهيدروكسيل تحل محل الهاليدات التي تعود الى هاليدات الالكيل بسرعة أكبر مقارنه مع جزيئات الماء المتعادلة كما تسهل الحوامض على نزع المجاميع المغادرة عندما تكون قواعد قوية، يمكن تقسيم الحامض - القاعدة للتفاعلات العضوية الى ثلاث انواع رئيسية هي:

1. تحفيز الحامض - القاعدة المعينة أو الخاصة.

2. تحفيز الحامض - القاعدة العام.

3. تحفيز الحامض - القاعدة للويس.