هناك نوعان من عملية الفسفرة وهما: 1- الفسفرة بمستوى المادة الاساس والتي تسمى substrate level phosphorylation وفي هذه العملية تنتج مشتقات للمادة الاساس بصيغة مفسفرة او بصيغة ثايواستر وبالتالي يستخدم هذا لانتاج ATP ومن الامثلة على ذلك هي تفاعلات انحلال السكر Glycolysis حيث يتكون المركبان phosphoglycerate 1,3 والمركب الآخر هو phosphonol pyruvate واللذان يتفاعلان مع الـ ADP ليكونا ATP والمثال الاخر هو المركب Succinyl COA والمتكون في دورة كريبس والذي يستعمل في تحول GDP ألى GTP ويتحول الاخير بتفاعل آخر ألى ATP.

2- الفسفرة التاكسدية الهوائية ان الفسفرة التاكسدية للـ ADP تحدث على حساب كمية كبيرة من الطاقة الناتجة عن انتقال الالكترونات خلال السلسلة التنفسية من الـ NADH ألى الأوكسجين الجزيئي. توجد ثلاث نقاط معينة خلال السلسلة التنفسية تتحول فيها طاقة الاكسدة والاختزال لانتقال الالكترونات الى طاقة الآصرة الفوسفاتية من الـ ATP ولهذا السبب فان الفسفرة التاكسدية تسمى ايضا بالفسفرة بالسلسلة التنفسية وان التفاعل الكلي المزدوج لانتقال الالكترونات والسلسلة التنفسية هو: NAD+NADH+H+ +3ADP+3Pi+1/2024H20+3ATP ان الطاقة الكلية الناتجة عن اعادة اكسدة NADH بواسطة السلسلة التنفسية تكون كبيرة بحوالي 52.5 كيلو سعرة / مول وهكذا فان سلسلة نقل الالكترونات (السلسلة التنفسية) هي عبارة عن سلسلة منظمة تعمل على تجزئة الطاقة الحرة المتناقصة بكثرة اثناء انتقال زوج الالكترونات من الـ NADH ألى الأوكسجين الجزيئي بشكل مجموعات مفيدة من الـ ATP عند اكسدة الـ NADH بواسطة O₂ عبر سلسلة نقل الالكترونات فانه تنتج ثلاث جزيئات من ATP