يعد قسم الشؤون المالية في العتبة العلوية المقدسة أحد أهم مفاصل وقواعد المنظومة الإدارية الموجودة في العتبة العلوية المقدسة لمسؤوليته المباشرة والرئيسية عن جميع المعاملات المالية والمصرفية للعتبة المقدسة مع مختلف المؤسسات في البلد، لديمومة واستمرار الخطط والمشاريع الطموحة التي تقوم بها الأمانة العامة للعتبة المقدسة للمنتسبين مع تقديم أفضل الخدمات للزائرين ولمدينة النجف الأشرف.
وحول طبيعة الإطار العام لعمل القسم وهيكليته ، قال رئيس قسم الشؤون المالية كرار شاكر الشمّاع في تصريح للمركز الإعلامي للعتبة المقدسة " يتكون القسم من 5 شعب هي ( الحسابات المالية، الحسابات المخزنية ، الرواتب ، أمانة الصندوق ، البطاقة الذكية ".
وأضاف الشماع " يقوم القسم بإدارة الأموال ووضع انسيابية منظمة لصرف باستلام وصرف الأموال العامة المطلقة والشرعية (الموقوفات والنذور) واستكمال معاملات الصرف بما يتلاءم مع الشرع الحنيف وضوابط الصرف المالي".
وتابع" قمنا بتطوير القسم من العام 2005 بشكل مستمر من خلال إدخال التقنيات الالكترونية في أعماله ( الحاسوب) وكذلك إدخال تطوير المهارات الفردية للمنتسبين من خلال ادخالهم في عدة دورات تطويرية ضمن اختصاص أعمالهم لتقييد الأعمال الحسابية في سجلات مالية خاصة من خلال اعتماد تفرعات النظام المحاسبي الموحد المعتمد في تبويب الموجودات والمطلوبات والمصروفات والموارد .. الخ ".
وأوضح " فيما يتعلق  بشعبة الحسابات المالية تتكون من عدة وحدات، منها ( وحدة الصرف)، ( وحدة حسابات الخطة الاستثمارية)، ( وحدة السجلات )، ( وحدة إدخال معلومات الحاسوب الالكتروني)، و ( وحدة السلف)، كل وحدة من هذه الوحدات حسابية ومالية مختصة، أهمها الأعمال الخاصة بمصاريف العتبة المقدسة التشغيلية، ومتابعة السلف المستديمة ومشاريع الخطط الاستثمارية بين العتبة المقدسة والوقف الشيعي ومسك السجلات المالية، فيما تتكون شعبة الحسابات المخزنية، من وحدتين، (الموجودات الثابتة) و(متابعة المخزون)".