يعد قسم تنقية المياه والصناعات الكيمياوية‏ في العتبة العلوية المقدسة من الأقسام المهنية التي تعمل على إنتاج المنظفات والمعقمات بمختلف أنواعها في صناعة محلية واعدة تساهم في دعم المنتج الوطني وتحمل علامة (القسيم). وعن طبيعة العمل وأصناف المواد المنتجة قال رئيس القسم المهندس فاضل الطباطبائي ، لـ( المركز الخبري) " تتضمن هيكلية القسم العديد من الشعب منها ( شعبة تنقية المياه ، شعبة محطات الماء ، شعبة تصنيع منظومات التحلية، شعبة المنظفات ، شعبة المختبر) ، حيث تعمل الكوادر الهندسية والفنية التخصصية في شعبة صناعة المنظفات بصناعة وإنتاج مختلف المنظفات والمعقمات ذات الجودة العالية لسدِّ حاجة العمل في مختلف أقسام العتبة المقدسة ولخدمة الزائرين الكرام على مدار الساعة، اضافة الى مراكز البيع المباشر لشركة فيض القسيم ".
وأضاف " الجانب الآخر من العمل في الشعبة، هو الاستثمار الخارجي في بيع منتجاتنا من المعقمات والمنظفات والتي شهدت انتشارا واسعا نتيجة الجودة العالية لتصل منتجات العتبة العلوية المقدسة الى جميع محافظات العراق، وقد ساهمت في سدّ حاجة أقسام وشُعب العتبة كشعبة غسل السجاد ، وقسم السلامة المهنية والصحة والبيئة، وقسم الشؤون الخدمية ، إضافة الى سدّ الحاجة للسوق المحلية والذي أثمر عن استقرار الأسعار فيما يتعلق بالمنظفات والمعمقات بمختلف أنواعها ".
وأكمل " فيما يتعلق بشعبة محطات الماء تقوم كوادرها بعمل ميداني لصيانة خزانات المياه بمختلف أحجامها وسعاتها لما يسهم في وصول المياه النقية الى الزائرين وبقية مفاصل العمل والخدمة في العتبة المقدسة ، في وقت أنتجت الشعبة منتجها الجديد الخاص بتصنيع (علب المنظفات) من خلال أجهزة تصنيع ذات جودة عالية نحو (500 ) علبة في الساعة مختلفة الأحجام  .
وتابع " كما تعمل شعبة تنقية المياه على إيصال المياه النقية الصالحة للشرب الى الزائرين الكرام عبر مشارب منتشرة في جميع الأرجاء الداخلية والخارجية للصحن الحيدري الشريف، اضافة الى تجهيز مراوح الرذاذ ، ومنظومات التبريد المتنقلة ، مع العمل على التجهيز المجاني للمياه النقية في المدينة القديمة عبر المشارب الثابتة في موقع القسم ، وعبر السيارات الحوضية لجميع النقاط الأمنية والمواكب الحسينية وبشكل مجاني على مدار الساعة .
وللقسم وشعبه تعاون ميداني واسع خلال الزيارات المليونية ومنها زيارة الأربعين ، وإحياء ذكرى وفاة النبي الأكرم محمد (ص وآله)، فضلا عن تصنيع منظومات المياه النقية التي تم تجهيزها بنجاح في مختلف مفاصل الخدمة داخل العتبة المقدسة والعديد من المستشفيات والدوائر الرسمية بمحافظة النجف الأشرف .