تسمية وتصنيف فايروسات النبات

تعد التسمية والتصنيف من الضرورات اللازمة لدراسة ووصف الكائنات الحية والغاية من التصنيف هي جمع الكائنات في مراتب تصنيفية تربطها علاقات التماثل والاختلاف في الصفات لذا يمكن تعريف تصنيف الفايروسات بأنها "عملية ترتيب الفايروسات في مراتب تصنيفية ذات قرابة وفقا للصفات المشتركة والمختلفة بينها". مرت عملية تسمية وتصنيف فايروسات النبات بمراحل تطورية عديدة وذلك منذ اكتشاف الفايروسات في أواخر القرن التاسع عشر إلى أن انتهى بنظام التصنيف الحالي المعتمد والذي أقرته "اللجنة الدولية لتصنيف الفايروسات" International Committee on Taxonomy of viruses والتي تعرف اختصارا ICTV وهي اللجنة المخولة بتسمية وتصنيف الفايروسات والتي تضم عددا من اللجان الفرعية إحداها "لجنة فايروسات النبات".

يمثل نظام التصنيف الحالي المعتمد للفايروسات النظام المنطقي القادر على تقديم مؤشرات عن تطور الفايروسات وذلك لأنه جاء تتويجا لعدة نظم سابقة كما أنه جيد التنظيم ومستند على خصائص فايروسية واضحة وثابتة مناسبة لإظهار حالات التماثل والاختلاف بين الفايروسات ولم يتم إدخال الفايروسات ضمن النظم التصنيفية المعتمدة للكائنات الحية لأنه كائن غير خلوي لذا وضعت الفايروسات في مجموعة تصنيفية مستقلة لا علاقة لها باي مجموعة من الكائنات الحية.

1. تسمية فايروسات النبات

مرت تسمية فايروسات النبات Virus nomenclature بمراحل عديدة ووضعت طرقا عديدة ومتنوعة لتسميتها وأهمها التسمية باستعمال الاسم الانكليزي الشائع باللغة المحكية حيث أعتمد في هذه التسمية على نظام يستند على استعمال أسم النبات الذي سجل عليه الفايروس لأول مرة كعائل طبيعي له متبوعا بالأعراض التي يسببها عليه ويتبع ذلك بكلمة "فايروس" ومثال ذلك تسمية فايروس موزائيك التبغTobacco mosaic virus  وتبدأ الكلمة الأولى للاسم بحرف استهلالي كبير، وأقرت لجنة ICTV سنة 1991 استعمال الاسم العلمي للفايروسات المكون من مقطعين الأول هو الاسم الانكليزي الشائع والذي يتكون من كلمتين أو أكثر لاسم النبات العائل ونوع الأعراض والثاني هو اسم الجنس الذي ينتمي إليه ذلك الفايروس ويكتب بأحرف مائلة وبذلك أصبح اسم فايروس موزائيك التبغ بموجب هذا النظام المقترح هو Tobacco mosaic Tobamovirus ثم وضعت اللجنة المذكورة في سنة 1998 النظام الجديد المعتمد حاليا لتسمية الفايروسات والذي ضم النقاط التالية (1) حذف اسم الجنس من الاسم العلمي وإرجاع كلمة Virus محله (2) يكتب الاسم العلمي للفايروس بأحرف مائلة وهو يمثل اسم النوع Species لذلك الفايروس (3) تبدأ الكلمة الأولى للاسم بحرف استهلالي كبير (4) عند ورود اسم الفايروس لأول مرة في أي مقالة علمية يكتب اسم العائلة ثم الجنس بالأحرف المائلة متبوعا بالاسم العلمي للفايروس ثم مختصر الاسم Acronomy بين قوسين بأحرف كبيرة، ومثال على ذلك تسمية فايروس الموزائيك الاصفر للفاصوليا(Potyviridae, Potyvirus) Bean yellow mosaic virus (BYMV) وتسمية فايروس موزائيك التبغ (Tobamovirus) Tobacco mosaic virus (TMV) حيث ذكر فقط اسم الجنس لهذا الفايروس لأنه لم ينتمي إلى عائلة لغاية اليوم، وهكذا فان صيغة التسمية الحالية هذه هي المعتمدة حاليا وهي تختلف عن نظام تسمية الكائنات الحية الذي يعتمد نظام التسمية العلمية الثنائية المكون من اسم الجنس والنوع وباستعمال الكلمات اللاتينية عادة.

الاسم المختصر للفايروسات

تم اعتماد الاسم المختصر للفايروسات , Acronomy Abbreviation من قبل لجنة ICTV للإشارة إلى نوع الفايروس والذي يتكون من الأحرف الأولى عادة للكلمات المكون منها اسم النوع الفايروسي ويكتب بالأحرف الاستهلالية الكبيرة ومثال ذلك مختصر فايروس موزائيك التبغ Tobacco mosaic virus هو (TMV) ومختصر فايروس الموزائيك الاصفر للفاصوليا Beam yellow mosaic virus هو (BYMV) ولكن نظرا لإمكانية تماثل مختصرات بعض الفايروسات إذا ما اعتمد فقط على الأحرف الأولى للكلمات المكونة لاسم الفايروس ومثال ذلك فايروسي موزائيك البنجرBeet mosaic virus  وموزائيك البروم Brome mosaic virus لذلك فقد وضعت اللجنة المذكورة قواعد متفق عليها لاختصار الاسم العلمي لكل فايروس نباتي وأصدرت قائمة رسمية معتمدة للأسماء المختصرة لكل فايروسات النبات والتي نشرتها سنة 1996.

2. تصنيف فايروسات النبات

صنفت فايروسات النبات إلى 17 عائلة Family و 66 جنسا Genus و 970 نوعا Species وكما يلي:

1. الفايروسات ذات جينوم الدنا المزدوج dsDNA viruses

إن كل فايروسات النبات ذات جينوم الدنا المزدوج هي من فايروسات الاستنساخ العكسي  dsDNA-RT Virusesوتنتمي جميعها الى عائلة Caulimoviridae.

عائلة Caulimoviridae

تضم فايروسات النبات التي تتضاعف بالاستنساخ العكسي Reverse transcription وهي فيروسات ذات جينوم دنا حلقي مزدوج الخيط dsDNA يمتاز بوجود فجوات Gaps أو تسمى Discontinuities توجد في مواقع مخصصة فيه حيث توجد فجوة واحدة في الخيط الأول وفجوة – ثلاث فجوات في الخيط الثاني وتمثل هذه الفجوات المواقع الابتداء" Priming Sites لبدء تضاعف الجينوم، لا ينتمي لهذه العائلة أي فايروس غير نباتي وهي تضم ستة أجناس تقع في مجموعتين هما مجموعة فايروسات الجنس Caulimovirus الأيزومتري الجسيمات ومجموعة الجنس Badnavirus الباسيلية الجسيمات وتتميز أجناس هذه العائلة عن بعضها بالتنظيم الجينومي. وفيما وصفا لهذه الأجناس:

أ- الجنس Caulimovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس موزائيك القرنابيط Caulifower mosaic virus (CaMV) واسم الجنس مشتق من الاسم العلمي للفايروس الممثل، الفريونات أيزومترية بقطر 50 نانومتر وتوجد عادة داخل أجسام ضامة سايتوبلازمية داخل الخلايا، يتكون الجينوم من ستة هياكل تشفيرية مفتوحة Open read frames , ORFs، ومعظم أنواع هذا الجنس منقولة بحشرات المن بالطريقة شبه الباقية ويحتاج النقل إلى بروتين مساعد يشفره الفايروس.

ب - الجنس الشبيه بفايروس التبرقش الاصفر لفول الصويا

 Soybean chlorotic mottle virus-like

النوع الممثل للجنس هو فايروس التبرقش الاصفر لفول الصويا (Soybean chlorotic mottle virus (SbCMV وهو جنس يشبه الجنس السابق كثيرا في كل الصفات باستثناء بعض الاختلافات الطفيفة في التنظيم الجينومي.

ج- الجنس الشبيه بفايروس الموزائيك العرقي للكاسافا

 Cassava vein mosaic virus-like

النوع الممثل للجنس هو فايروس الموزائيك العرقي للكاسافا (Cassava vein mosaic virus (CSVMV وهو جنس يشبه الجنس Caulimovirus كثيرا في كل الصفات باستثناء بعض الاختلافات الطفيفة في التنظيم الجينومي.

د- الجنس الشبيه بفايروس وضوح عروق البتونيا

 Petunia vein clearing virus-like

النوع الممثل للجنس هو فايروس وضوح عروق البتونيا Petunia vein clearing virus (PVCV) وهو جني يشبه الجنس Caufimovirus كثيرا  في كل الصفات باستثناء بعض الاختلافات الطفيفة في التنظيم الجينومي.

هـ- الجنس Badnavirus

اسم الجنس مشتق من مصطلح "فايروسات الدنا الباسيلية" Bacillus DNA Viruses، الفريونات باسيلية الشكل بأبعاد 130 × 30 نانومتر، يتكون الجينوم من ثلاثة هياكل تشفيرية مفتوحة ORFs ويشفر الهيكل التشفيري الثالث بروتين كبير متعدد Polyprotein الذي يتفكك ليعطي الغطاء البروتيني وإنزيمات Aspartate protease والاستنساخ العكسي RTase و RNaseH، معظم أنواع هذا الجنس منقولة بحشرات البق الدقيقي بالطريقة شبه الباقية.

و- الجنس الشبيه بفايروس تدهور الرز الباسيلي

 Rice tungro baciliform virus-like

النوع الممثل للجنس فايروس تدهور الرز الباسيلي (Rice tungro bacilliform virus (RTBV وهو يماثل في صفاته الجنس السابق إلا أن الجينوم يتكون من أربع هياكل تشفيرية ويسبب فايروس تدهور الرز الباسيلي سوية مع فايروس تدهور الرز الكروي Rice tungro spherical virus (RTSV) الذي يعود إلى عائلة أخرى، مرض تدهور الرز Tungro disease، وهو يعتمد على الفايروس RTSV لنقله بقفاز الأوراق.

2. الفايروسات ذات جينوم الدنا المفرد ssDNA Viruses

تنتمي هذه الفايروسات إلى عائلتين هما:

1) عائلة Geminiviridae

تمتاز هذه الفايروسات بأن العديد من الأنواع التابعة لها تتكون من جسيمات توأمية أيزومترية Geminate ومنها اشتق اسم العائلة أي أن الفريون يتكون من جسيمتين يتوزع بينهما الجينوم الفايروسي ولا تضم هذه العائلة أي فايروس غير نباتي وفيها أربعة أجناس تتباين في تنظيمها الجينومي وهي:

أ- الجنسي Mastrevirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تخطيط الذرة (Maize streak virus (MSV ومنه اشتق اسم الجنس ومعظم أنواعه مرتبطة طبيعيا بالعائلة النجيلية Poaceae، الفريون أحادي الجسيمة والجينوم وحيد القطعة غير مجزأ Monopartite genome وتنقل أنواعه بحشرات قفازات الأوراق بالطريقة الباقية غير المتضاعفة.

ب - الجنس Curtovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تجعد قمة البنجر (Beet curly top virus (BCTV ومنه اشتق اسم الجنس، والفريون أحادي الجسيمة والجينوم وحيد القطعة غير مجزأ، تنقل أنواعه بحشرات قفازات الأوراق بالطريقة الباقية غير المتضاعفة.

ج- الجنس Begomovirus

النوع الممثل فايروس الموزائيك الذهبي للفاصوليا (Bean golden mosaic virus (BGMV ومنه اشتق اسم الجنس وهو الجنس الأكبر في هذه العائلة حيث يضم عددا كبيرا من الأنواع، معظم أنواعه هي فريونات ثنائية الجسيمة والجينوم مجزأ بينهما وفيه عدد من الأنواع وحيدة الجسيمة تنقل أنواعه بحشرات الذباب الأبيض.

د- الجنس Торсuvіrus

النوع الممثل فايروس تجعد القمة الكاذب للطماطة Tomato pseudo curly top virus (TPCTV) ومنه اشتق اسم الجنس، وكانت أنواع هذا الجنس سابقا منضمة تحت الجنس Curtovirus بسبب التشابه الكبير في التنظيم الجينومي بينها، تنقل أنواعه بحشرات قفازات الأشجار.

2) عائلة Circoviridae

أنواع هذه العائلة ذات فريونات أيزومترية عشرينية الأوجه صغيرة بقطر 17-22 نانومتر والجينوم دنا مفرد حلقي Circular ssDNA وهي تضم جنسين، يضم الأول فايروسات نباتية فيما يضم الثاني فايروسات حيوانية. وفيما يلي وصف للجنس الأول.

آ- الجنس Nanovirus

النوع الممثل فايروس تقزم البرسيم تحت الأرضي Subterranean clover Stunt virus (SCSV) وأشتق اسم الجنس من الكلمة الإغريقية Nano وتعني "صغير" وذلك بسبب صغر حجم جسيمات هذه الفايروسات، الفريون أيزومتري بقطر 20 نانومتر يضم جينوما مقسما إلى ست جزيئات حلقية معبأة داخل الفريون.

3. الفايروسات ذات جينوم الرنا المزدوج الخيط dsRNA viruses

تنتمي هذه الفايروسات إلى عائلتين وجنس مستقل واحد.

1) عائلة Reoviridae

تضم هذه العائلة ثلاثة أجناس لفايروسات نباتية فضلا عن أجناس أخرى لفايروسات متطفلة على الفقاريات واللافقاريات وفيما يلي وصف الأجناس الفايروسات النباتية الثلاثة.

أ- الجنس Fijivirus

 النوع الممثل للجنس هو فايروس مرض فيجي Fiji disease virus ومنه اشتق اسم الجنس، والفريون أيزومتري أحادي الجسيمة بقطر 65-70 نانومتر ومغلف بغلاف مزدوج ويضم جينوم مقسم إلى عشر قطع وهي فايروسات متخصصة علي نباتات ذات الفلقة الواحدة وخاصة النجيليات، وتنقل بحشرات قفازات الأوراق بالطريقة الباقية المتضاعفة.

ب- الجنس Oryzavіrus

النوع الممثل للجنس فايروس التقزم الخشن للرزRRSV) Rice ragged stunt virus) واسم الجنس مشتق من الاسم العلمي لنبات الرز وذلك لأن أنواع هذا الجنس عزلت طبيعيا من هذا النبات وهي تصيب النجيليات، والفريون أيزومتري مزدوج الغلاف بقطر 75-80 نانومتر يضم جينوما مقسما إلى 10 قطع وتنقل أنواعه بحشرات قفازات النبات بالطريقة الباقية المتضاعفة.

ج- الجنس Phytoreovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس التورم الجرحي Wound tumor virus (WTV)، واسم الجنس مشتق من مصطلح "فايروسات الريو النباتية" حيث أن كلمة Phyto تعني "نبات"، والفريون أيزومتري مزدوج الغلاف بقطر 70 نانومتر يضم جينوما مقسما إلى 12 قطعة وتنقل أنواعه بحشرات قفازات الأوراق بالطريقة الباقية المتضاعفة.

2) عائلة Partitiviridae

تضم هذه العائلة جنسين يضمان فايروسات نباتية وجنسين آخرين يضمان فايروسات فطرية، والفريونات أيزومترية غير مغلفة بقطر 30-40 نانومتر، والجينوم مقسم إلى قطعتين حيث تشفر القطعة الكبيرة إنزيم التضاعف RdRp فيما تشفر القطعة الصغيرة الغطاء البروتيني وكل الفايروسات النباتية التابعة لهذه العائلة تعرف بالفايروسات المختفية Cryptic viruses لأنها لا تسبب أية أعراض على عوائلها النباتية أو تسبب أعراضا خفيفة جدا وهي لا تنقل بالتطعيم ولا يوجد لها ناقلات ولكنها تنقل بالبذور وتنتقل داخل النبات بواسطة انقسام الخلايا المصابة وليس بحركة الفايروس عبر الخلايا.

أ- الجنس Alphacryptovirus

النوع الممثل الفايروس الأول الكامن للبرسيم الأبيض White Clover Cryptic virus 1 (WCCV-1) ، الفريون أيزومتري بقطر 30 نانومتر ويبدوا السطح الخارجي للفريون أملسا ويضم الفريون الجينوم المقسم إلى قطعتين بحجم 2 و 1,7 كيلوقاعدة (Kb) على التوالي.

ب- الجنس Betacryptovirusi

النوع الممثل الفايروس الثاني الكامن للبرسيم الأبيض White clover cryptic virus 2 (WCCV-2) والفريون آيزومتري بقطر38 نانومتر وسطحه الخارجي خشن نسبيا، يضم الفريون الجينوم المقسم إلى قطعتين بحجم 2,1 و 2,25 كيلوقاعدة (Kb) على التوالي.

3) الجنس المستقل Varicosavirus

لا زالت العديد من الأجناس الفايروسية غير منظمة إلى عوائل فايروسية ويطلق عليها الأجناس المستقلة أو الطافية Floated genera ومنها الجنس المذكور، النوع الممثل للجنس هو فايروس العرق الكبير للخس (Lettuce big vein virus (LBVV، والفريونات عصوية بطول 320-360 نانومتر ويضم الفريون جينوم من النوع dsRNA مقسم إلى قطعتين، وتنقل أنواعه بالفطريات الكتريدية Chytrid fungi وخاصة بالفطر Olpidium spp.

4. الفايروسات ذات جينوم الرنا المفرد سالب التوجه

 Negative sense ssRNA viruses

تنتمي هذه الفايروسات إلى عائلتين وجنسين مستقلين:

1) عائلة Rhabdoviridae

 تضم فايروسات مغلفة شبيهة بالإطلاقة أوباسيلية الشكل وغلافها الخارجي ذو أشواك كلايكوبروتينية تنطمر في الغلاف الذي يغلف الكابسيد الحلزوني الشكل، تضم هذه العائلة جنسين نباتيين وأجناس لفايروسات فقارية ولافقارية وأهم ناقلات الفايروسات النباتية في هذه العائلة هي حشرات قفازات الأوراق وقفازات النبات والمن والحلم والبق النباتي، ومشتق اسم العائلة من كلمة Rhabdos الإغريقية وتعني "عصية".

أ- الجنس Cytorhabdovirus

النوع الممثل فايروس الاصفرار التمأوتي للخس (Lettuce necrotic yellows virus (LNYV. الفريون بطول 60 نانومتر، اشتق اسم الجنس من اسم العائلة وموقع تضاعف الفايروس الذي يتم في السايتوبلازم في المنطقة المحيطة بالنواة أو في الشبكة الاندوبلازمية.

ب- الجنس Nucleorhabdovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس التقزم الاصفر للبطاطا (Potato yellow dwarf virus (PYDV. الفريون بطول 90 نانومتر، اشتق اسم الجنس من اسم العائلة وموقع تضاعف الفايروس الذي يتم في نواة خلية العائل.

2) عائلة Bunyaviridae

هي عائلة تضم عددا كبيرا من الفايروسات التي تصيب الفقاريات واللافقاريات، وتضم جنسا واحدا يضم فايروسات نباتية، الفريونات كروية أو متعددة التشكل Pleomorphic وذات سطح يحوي أشواك كلايكوبروتينية منطمرة في غلاف ليبيدي مزدوج.

أ- الجنس Tospovirus

هو الجنس الوحيد الذي يضم فايروسات نباتية في هذه العائلة والنوع الممثل للجنس هو فايروس الذبول المبقع للطماطة (Tomato spotted Wilt virus (TSWV ومنه اشتق اسم الجنس، يضم الفريون جينوم مقسم إلى ثلاث قطع اثنان منها تتضاعف باستراتيجية ثنائية التوجه بالحالتين السالبة والموجبة معا Ambisense أما القطعة الثالثة فهي سالبة التوجه وهي القطعة الأكبر، وتنقل أنواع هذا الجنس بحشرات الثربس بالطريقة الباقية المتضاعفة.

3) الجنس المستقل Tenuivirus

تتماثل أنواع هذا الجنس في معظم صفاتها مع فايروسات عائلة Bunyaviridae ولكن لم يتم ضم هذا الجنس إليها بسبب نقص في المعلومات الجزيئية المتوفرة عنه والنوع الممثل للجنس هو فايروس تخطط الرز (Rice stripe virus (RSV، الفريونات غير مغلفة خيطية مرنة طويلة وبقطر 3-10 نانومتر وهي فايروسات متخصصة على النجيليات وتنقل بحشرات قفازات النبات بالطريقة الباقية المتضاعفة.

4) الجنس المستقل Ohiovirus

تتماثل أنواع هذا الجنس أيضا في معظم صفاتها مع فايروسات عائلة Bunyaviridae والنوع الممثل للجنس هو فايروس تقرح الحمضيات (Citrus psorosis virus (CPSV، الفريون غير مغلف خيطي وغالبا ما يأخذ الجينوم شكلا حلقيا، لم يسجل أي ناقل لفايروسات هذا الجنس.

5. الفايروسات ذات جينوم الرنا المفرد موجب التوجه

Positive sense ssRNA viruses

تمثل هذه الفايروسات الغالبية العظمى من فايروسات النبات الأكثر خطورة على النباتات. تنتمي هذه الفايروسات إلى تسعة عوائل فايروسية وأحد عشر جنسا مستقلا، وهي تضم فايروسات نباتية فقط، وفيما يلي وصفا لهذه العوائل والأجناس:

1) عائلة Bromoviridae

أنواعها ذات فريونات ثلاثية الجسيمات الأيزومترية بقطر 26-35 نانومتر أو باسيلية، والجينوم مقسم بينها، لمعظم أنواعها فايروسات تابعة Satellite viruses، أو تحتوي على أحماض رايبية ناقصة Defective RNAs، تضم هذه العائلة خمسة أجناس هي:

أ- الجنس Bromovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس موزائيك البروم (Brome mosaic virus (BMV ومنه اشتق اسم الجنس واسم العائلة، الفريون ثلاثي الجسيمات الأيزومترية بقطر 27، وتنقل معظم أنواعه بواسطة الخنافس وميكانيكيا.

ب- الجنس Сuсumоvirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس موزائيك الخيار (Cucumber mosaic virus (CMV ومنه اشتق اسم الجنس والفريون ثلاثي الجسيمات الأيزومترية بقطر 30 نانومتر، تنقل جميع أنواعه بحشرات المن بالطريقة غير الباقية.

ج- الجنس Alfamovirus

جنس وحيد النوع Monospecific genus أي لا يضم إلا النوع الممثل وهو فايروس موزائيك الجت (Alfalfa mosaic virus (AMV ومنه اشتق اسم الجنس، الفريونات باسيلية بأبعاد 30-57 × 18 نانومتر، وينقل بالمن بالطريقة غير الباقية.

د- الجنس llarvirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تخطط التبغ (Toacco streak virus (TSV ، الفريونات شبه أيزومترية Quasi-isometric متباينة الأشكال بين الكروية والباسيلية، وهي فايروسات متخصصة على النباتات الخشبية ومنها أشجار الفاكهة.

هـ- الجنس Oleavirus

هو جنس أحادي النوع يضم النوع الممثل للجنس هو الفايروس الكامن الثاني للزيتون (Olive latent virus 2 (OLV2 ومنه اشتق الفريون باسيلي بقطر 26 وطول 55 نانومتر، ولا يعرف له ناقل.

2) عائلة Comoviridae

الفريونات أيزومترية ثنائية الجسيمة والجينوم موزع بينهما وتضم ثلاثة أجناس هي:

أ- الجنس Comovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس موزائيك اللوبيا Cowpea mosaic virus (CPMV) ومنه اشتق اسم الجنس والعائلة وتنقل أنواعه بخنافس Chrysomelid beetles.

ب- الجنس Fabayirtus

يمثل الجنس فايروس ذبول الباقلاء الأول (1-Broadbeam wilt virus 1 (BBWV واسم الجنس مشتق من الاسم العلمي لنبات الباقلاء Vicia faba وتنقل أنواعه بحشرات المن بالطريقة غير الباقية.

ج- الجنس Nepovirus

يمثل الجنس فايروس التبقع الحلقي للتبغ (Tobacco ringspot virus (TRSV واسم الجنس مشتق من مصطلح Nematode polyhedral Viruses أي "الفايروسات البلورية المنقولة بالنيماتودا" وتنقل معظم أنواعه بالنيماتودا العائدة لعائلة Longidoridae وينقل بعضها بحبوب اللقاح فيما ينقل نوع واحد منها وهو الفايروس المرافق لتدهور التوت الأسودBlackcurrant reversion associated virus (BRAV) بواسطة الحلم.

3) عائلة Potywiridae

هي أكبر عائلة فايروسية وتضم العديد من الفايروسات المهمة اقتصاديا، الفريونات عصوية مرنة مفردة الجسيمة بأبعاد 650-900 × 11-15 نانومتر، والجينوم غير مقسم باستثناء أنواع الجنس Bymovirus حيث يقسم الجينوم بين جسيمتين وتنقل أنواعها بأنواع مختلفة من الناقلات واعتمدت هذه الصفة كإحدى الصفات التي اعتمدت في تعريف أجناس العائلة، تضم هذه العائلة ستة أجناس هي:

أ- الجنس Potyvirus

هو أكبر جنس فايروسي يضم فايروسات للنبات. والنوع الممثل للجنس هو فايروس البطاطا واي (PVY) Potato virus Y ومنه أشتق اسم الجنس والعائلة، الفريونات بإبعاد 680-900 × 11-13 نانومتر والجينوم بحجم 9,7 كيلو قاعدة وتنقل أنواعه بحشرات المن بالطريقة غير الباقية.

ب- الجنس Іроmоvirus

يعد فايروس التبرقش المعتدل للبطاطا الحلوة Sweet potato mile mottle virus (SPMMV) هو النوع الممثل للجنس وأن اسم الجنس مشتق من اسم جنس البطاطا الحلوة Ipomia ، الفريونات بطول 800-950 نانومتر تضم جينوما بحجم 10,8 كيلو قاعدة والناقل الرئيسي لهذه الفايروسات هي حشرة الذبابة البيضاء Bemisis tabaci.

ج- الجنس Macluravirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس موزائيك الماكلورا Maclura mosaic virus (MacMV) ومنه اشتق اسم الجنس، الفريونات بطول 650 نانومتر والجينوم بحجم 8 كيلو قاعدة وتنقل أنواعه بحشرات المن بالطريقة غير الباقية.

د- الجنس Rуmоvirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس موزائيك الشيلم (Ryegrass mosaic virus (RGMV ومنه أشتق اسم الجنس، الفريونات بأبعاد 690-720 × 11 - 15 نانومتر والجينوم بحجم 9-10 كيلو قاعدة وتنقل أنواعه بالحلم الاريوفي.

هـ- الجنس Tritimovirus

النوع الممثل فايروس الموزائيك المخطط للحنطة Wheat streak mosaic virus (WSMV) واشتق اسم الجنس من اسم الجنس النبات الحنطة Triticus وكلمة موزائيك mosaic، الفريونات بطول 700 نانومتر والجينوم بحجم 8,5-9 كيلو قاعدة وتنقل أنواعه بالحلم الاريوفي بالطريقة الباقية، وهذه الفايروسات متخصصة على العائلة النجيلية.

و- الجنس Bуtоvirus

النوع الممثل للجنس فايروس الموزائيك الأصفر للشعير Barley yellowe mosaicvirus (BaYMV) ومنه اشتق اسم الجنس، يتكون الفريون من جسيمتين بأبعاد 250-300 و 500-600 × 13 نانومتر، وتحوي الجسيمة الطويلة الجينوم الأكبر والذي بحجم 7.5-8 كيلو قاعدة فيما تحوي الجسيمة الأقصر القطعة الأصغر من الجينوم والتي بحجم 3.5-4 كيلو قاعدة وتنقل أنواعه بأنواع من الفطريات البلازموديو فورية وتحديدا النوعPolymyxa graminis ، وهذه الفايروسات متخصصة على العائلة النجيلية.

4) عائلة Tombusviridae

الفريون جسيمة أحادية أيزومترية بقطر 32–35 نانومتر تحوي جينوما وحيد القطعة بحجم 4,7-3,7 كيلو قاعدة وتضم فايروسات ثابتة تتحمل البقاء خارج النبات في التربة والمياه حيث تصيب النباتات مباشرة من دون ناقل، وتضم هذه العائلة ثمانية أجناس تتباين في التنظيم الجينومي وهي:

أ- الجنس Тоmbusvirus

النوع الممثل للجنس فايروس التقزم الشجيري للطماطة (Tomato bushy stunt virus (TBSV ومنه اشتق اسم الجنس والعائلة، الفريون أيزومتري بقطر 32–35 نانومتر والجينوم بحجم 4,7 كيلو قاعدة، معظم أنواعه محمولة بالتربة وليس لها ناقل.

ب- الجنس Aureuvirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس الباثوس الكامن (Pothos latent virus (PoLV وهو جنس وحيد النوع، الفريون أيزومتري بقطر 30 نانومتر دائري الحواف والجينوم بحجم 4,4 كيلو قاعدة وهذا الفايروس مسجل فقط في جنوب إيطاليا وينقل بالتربة والزراعة المائية.

ج- الجنس Avenavirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس التقزم الأصفر للشوفان Oat chlorotic stunt virus (OCSV) ومشتق اسم الجنس من اسم الجنس للشوفانVena  وهو جنس وحيد النوع، الفريون آيزومتري بقطر 35 نانومتر والجينوم بحجم 4.2 كيلو قاعدة وهو يصيب طبيعيا الشوفان فقط ويعتقد أنه ينقل بنوع من الفطريات.

د- الجنس Саrmоvirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تبرقش القرنفل Carnation mottle virus (CarMV) ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون أيزومتري بقطر 32-35 نانومتر والجينوم بحجم 3,8-4,4 كيلو قاعدة.

هـ- الجنسي Machlomovirus

النوع الممثل للجنس فايروس التبرقش الأصفر للذرة (Maize chlorotic mottle virus (MCMV ومنه اشتق اسم الجنس الوحيد النوع، الفريون أيزومتري بقطر 30 نانومتر والجينوم بحجم 4,4 كيلو قاعدة ويصيب أنواع من العائلة النجيلية فقط وينقل بخنافس Chrysomelid وحشرات الثربس.

و- الجنس Necrovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس موت التبغ (Tobacco necrosis virus (TNV ومنه اشتق اسم الجنسي، الفريون آيزومتري بقطر 28 نانومتر والجينوم بحجم 3.7 كيلو قاعدة، وعادة ما تتقيد الإصابة بجذور النباتات وتنقل أنواعه بالفطريات الكتريدية وتحديدا الفطر Ospidium brassicae.

ز- الجنس Panicovirusia

النوع الممثل للجنس هو فايروس موزائيك البانكم (Panicum mosaic virus (PMV ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون أيزومتري بقطر 30 نانومتر والجينوم بحجم 4,3 كيلو قاعدة وتصيب أنواعه العائلة النجيلية فقط وتنقل ميكانيكيا فقط.

ح- الجنس Dianthovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس التبقع الحلقي للقرنفل Carnation ringspot virus (CRSV) واسم الجنس مشتق من اسم الجنس للقرنفلDianthus ، الفريون أيزومتري بقطر 35-32 نانومتر والجينوم مقسم داخله إلى قطعتين وتنقل أنواعه بالتربة من دون ناقل.

5) عائلة Sequiviridae

 الفريونات أيزومترية بقطر 30 نانومتر والجينومات بحجم 9-12 كيلو قاعدة، تضم العائلة جنسين مؤكدين وآخرين محتملين وهي:

أ- الجنس Sequivirus

النوع الممثل فايروس الترقط الاصفر للجزر الابيض (PYFV)Parsnip yelow fleck virus  ، الجينوم بحجم 10 كيلو قاعدة وتنقل أنواعه بحشرات المن بالطريقة شبه الباقية.

ب- الجنس Waikavirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تانجرو الرز الكروي Rice tungro spherical virus (RTSV) الجينوم بحجم 11 كيلو قاعدة، تنقل أنواعه بحشرات المن أو قفازات الأوراق بالطريقة شبه الباقية.

ج- الجنس المحتمل Sadwavirus

لا زال هذا الجنس مستقلا تصنيفيا ولكن للتشابه الكبير في التنظيم الجينومي مع جنسي العائلة أعلاه فهو مرشح للانضمام إليها، النوع الممثل للجنس هو فايروس تقزم الساتسوما (Satsuma dwarf virus (SDV ومنه اشتق اسم الجنس.

د- الجنس المحتمل Cheravirus

لا زال هذا الجنس مستقلا تصنيفيا ولكن نظرا للتشابه الكبير في التنظيم الجينومي مع جنسي العائلة أعلاه فهو مرشح للانضمام إليها، النوع الممثل للجنس هو فايروس الورقة الخشنة للكرز (Cherry rasp leaf virus (CRLV ومنه اشتق اسم الجنس.

6) عائلة Closteroviridae

 الفريونات أحادية الجسيمة خيطية مرنة جدا ورفيعة بقطر 12 نانومتر وهي تضم أطول فايروس نباتي وهو فايروس ترستيزا الحمضيات (Citrus tristeza virus (CTV وهو بطول 2000 نانومتر، الجينوم أحادي أو ثنائي القطعة، فايروسات هذه العائلة مرتبطة باللحاء عادة وتنقل أنواعها بحشرات المن أو البق الدقيقي أو الذباب الأبيض تضم العائلة ثلاثة أجناس هي:

أ- الجنس Closterovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس اصفرار البنجر (Beet yellow virus (BYV واسم الجنس مشتق من الكلمة الإغريقية Closter وتعني "خيط" لأنها فايروسات طويلة خيطية، الجينوم أحادي القطعة بحجم 15.5 – 19,3 كيلو قاعدة، الكابسيد مضلع عرضيا وتنقل أنواعه بحشرات المن أو البق الدقيقي أو الذباب الأبيض.

ب- الجنس Crimivirus

النوع الممثل فايروس الاصفرار المعدي للخس Lettuce infectious yellows virus (LIYV) ، يتكون الفريون من جسيمتين الأولى بطول 700-900 نانومتر والثانية بطول 650-850 نانومتر ويتوزع الجينوم بينهما، الكابسيد مضلع عرضيا وتنقل أنواعه بحشرات الذباب الأبيض بالطريقة شبه الباقية.

ج- الجنس Ampelovirus

الفايروس الممثل لهذا الجنس هو الفايروس الأول المرافق لالتفاف أوراق العنب Grapevine seafross-associated virus 1

7) عائلة Luteoviridae

الفريونات أيزومترية أحادية الجسيمة بقطر 25-30 نانومتر والجينوم أحادي القطعة بحجم 5,7-5,9 كيلو قاعدة وتتباين أجناسها في تنظيمها الجينومي ومعظم أنواعها تتطفل على اللحاء مسببة اصفرار عوائلها، مشتق اسم العائلة من الكلمة اللاتينية Luteus وتعني "الاصفرار" وتنقل أنواعها بحشرات المن بالطريقة الباقية وغالبا ما تساعد أنواعها فايروسات أخرى في النقل الحشري. تضم العائلة ثلاثة أجناس هي:

أ- الجنس Luteovirus

النوع الممثل فايروس التقزم الاصفر للشعير (BYDV-PAV) Barley yellow dwarf virus-PAV  تصيب أنواعه العائلة النجيلية وأسم الجنس مشتق من اسم العائلة.

ب- الجنسي Polerovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس التفاف أوراق البطاطا Potato leafroll virus 1 (PLRV) ومنه اشتق اسم الجنس.

ج- الجنس Еnаmоvirus

يعد فايروس الموزائيك والزوائد الورقية الأول للبزاليا 1 Pea emation mosaic virus هو النوع الممثل للجنس ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون أحادي الجسيمة أيزومتري بقطر 28 نانومتر.

8) عائلة Tymoviridae

تضم هذه العائلة جنسين هما:

أ- الجنس Туmоvirus

النوع الممثل للجنس فايروس الموزائيك الاصفر للشلغم (TYMV)  Turnip yellow mosaic virus ومنه اشتق اسم الجنس والعائلة، الفريون مكون من جسيمتين أيزومتريتين بقطر 30 نانومتر لكل منهما، الأولى تحوي الجينوم الكامل بحجم 6,3 كيلو قاعدة والثانية خالية من الجينوم، تصيب أنواعه نباتات من ذوات الفلقتين فقط وتنقل أنواعه بالخنافس.

ب- الجنس Marafivirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس ريادوفينو الذرة Maize rayado fino virus (MRFV) ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون مكون من جسيمتين أيزومتريتين بقطر 28-32 نانومتر لكل منهما الأولى تحوي الجينوم الكامل بحجم 6.5 كيلو قاعدة والثانية خالية من الجينوم. تصيب أنواعه العائلة النجيلية فقط وتنقل بقفازات الأوراق بالطريقة الباقية المتضاعفة.

9) عائلة Flexiviridae

تضم هذه العائلة سبعة أجناس هي:

أ- الجنس Allexivirusu

النوع الممثل للجنس هو فايروس الكراث الأندلسي أكس Shallot virus  X واسم الجنس مشتق من الاسم العلمي للنبات، الفريون أحادي الجسيمة الخيطية المرنة بأبعاد 800×12 نانومتر وتضم جينوما مفرد القطعة بحجم 9 كيلو قاعدة وتنقل أنواعه بالحلم الاريوفي.

ب- الجنس Capіllovіrus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تشقق ساق التفاح (Apple stem grooving virus (ASGV، الفريون خيطي مرن بأبعاد 640-700 × 12 نانومتر ويضم جينوما مفرد القطعة بحجم 6,5-7,4 كيلو دالتون ولا يعرف لأنواعه أية ناقلات.

ج- الجنس Foveаvіrus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تنقر ساق التفاح (ASPV)Apple stem pitting virus ، الفريون خيطي مرن بأبعاد 800×12 نانومتر ويضم جينوما مفرد القطعة بحجم 8,4- 9,3 كيلو دالتون، ولا يعرف لأنواعه أية ناقلات.

د- الجنس Trichovirus

 النوع الممثل فايروس تبقع الأوراق الأصفر للتفاح Apple chlorotic lear spot  virus (ACLSV) واسم الجنس مشتق من شكل الفريون الخيطي حيث تعني الكلمة اللاتينية Trichos "الخيط"، الفريون خيطي مرن بأبعاد 640-670× 12 نانومتر ويضم جينوما مفرد القطعة بحجم 7.5 كيلو دالتون، ولا يعرف لأنواعه أية ناقلات.

هـ- الجنس Vitivirus

 النوع الممثل للجنس هو فايروس العنب (Grapevine virus A (GVA ، واسم الجنس مشتق من اسم جنس نبات العنب Vitis ، الفريون خيطي مرن بأبعاد 725-825×12 نانومتر ويضم جينوما مفرد القطعة بحجم 7,6 كيلو دالتون، تنقل أنواعه بحشرات البق الدقيقي أو المن أو الحشرات القشرية بالطريقة شبه الباقية.

و- الجنس Pofexvirusil

النوع الممثل للجنس هو فايروس البطاطا أكس (Potato virus X (PVX ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون خيطي قليل المرونة بأبعاد 470–580×13 نانومتر ويضم جينوما مفرد القطعة بحجم 5.9-7 كيلو قاعدة، وتنقل أنواعه ميكانيكيا وليس لها ناقل.

ز- الجنس Cardavirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس القرنفل الكامن (Carnation latent virus (CLV ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون خيطي قليل المرونة بأبعاد 610-700 × 12-15 نانومتر ويضم جينوما مفرد القطعة بحجم 7,4-8,5 كيلو قاعدة، تنقل أنواعه بحشرات المن أو الذباب الأبيض أو ميكانيكيا.

10) الأجناس المستقلة (الطافية) Floating genera

هي أحد عشر جنسا ولم يتم ضمها إلى عائلة فايروسية بسبب صفاتها الفريدة وهي جميعها ذات جينوم sense ssRNA (+).

أ- الجنس Tobamovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس موزائيك التبغ (Tobacco mosaic virus (TMV ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون عصوي صلد بأبعاد 300-310 × 18 نانومتر والجينوم وحيد القطعة بحجم 6,3- 6,6 كيلو قاعدة وليس لأنواعه ناقل.

ب- الجنس Tobrayirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس خشخشة التبغ (Tobacco rattle virus (TRV ومنه اشتق اسم الفايروس، الفريون مكون من جسيمتين عصويتين صلدتين الأولى بطول 180 - 215 نانومتر والثانية بطول 46 - 115 نانومتر وكلاهما بقطر 20-22 نانومتر والجينوم موزع بينهما بحجم 6,8 و 4,5 كيلو قاعدة فيهما على التوالي، تنقل أنواعه بواسطة النيماتودا.

ج- الجنس Furovirusu

يعد فايروس موزائيك الحنطة المحمول بالتربة (Soil-borne wheat mosaic virus (SBWMV هو النوع الممثل واسم الجنس مشتقي من مصطلح الفايروس العصوي المحمول بالفطر" Fungus-borne rod shaped virus، الفريون مكون من جسيمتين عصويتين صلدتين الأولى بطول 260-300 نانومتر والثانية بطول 140-160 نانومتر وكلاهما بقطر 20 نانومتر والجينوم موزع بينهما بحجم 6-7 و 3,5-3,6 كيلو قاعدة على التوالي، ينقل الفايروس الممثل بالفطرPolymyxa graminis .

د- الجنس Ресluvirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تجعد فستق الحقل (Peanut clump virus (PCV ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون مكون من جسيمتين خيطيتين الأولى بطول 245 نانومتر والثانية بطول 190 نانومتر وكلاهما بقطر 21 نانومتر والجينوم موزع بينهما بحجم 5,9 و 4,5 كيلو قاعدة فيهما على التوالي، تنقل أنواعه بالفطريات البلازموديوفورية وخاصة الفطر Polymyxa graminis.

هـ- الجنس Pomovirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تكتل قمة البطاطا (PMTV)Potato mop-top virus  ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون مكون من ثلاث جسيمات عصوية بطول 290-310 و 150-160 و 65-80 نانومتر وبقطر 18-20 نانومتر والجينوم موزع بينها بحجم 6 و 3-3,5 و 2.5- 3 كيلو قاعدة على التوالي، تنقل أنواعه بالفطريات.

و- الجنس Benyvirus

يعد فايروس الاصفرار التماوتي لعروق البنجر Beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) النوع الممثل للجنس ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون مكون من أربع جسيمات عصوية بطول 390 و265 و 100 و 85 نانومتر وقطر 20 نانومتر والجينوم موزع بينها بحجوم 6,7 و 4,6 و 1,8 و 1,4 كيلو قاعدة، ويعتقد أن الفايروس الممثل يمتلك جسيمة خامسة تضم قطعة جينومية بحجم 1.3 كيلو قاعدة.

ز- الجنس Hordefvirus

النوع الممثل للجنس فايروس الموزائيك المخطط للشعير Barley Stripe mosaic virus (BSMV) واسم الجنس مشتق من اسم الجنس النبات الشعير Hordeum ، الفريون مكون من ثلاث جسيمات عصوية صلدة تتراوح أطوالها 110- 150 نانومتر وقطر 20 نانومتر والجينوم موزع بينها بحجوم 3,9 و 3,6 و 3,2 كيلو قاعدة، ولم يسجل لها ناقل ولكنها تنقل ميكانيكيا بكفاءة.

ح- الجنس Sobemovirus

يعد فايروس موزائيك الفاصوليا الجنوبي Southern bean mosaic virus (SBMV) هو النوع الممثل للجنس ومنه اشتق اسم الجنس، الفريون أحادي الجسيمة يضم جينوم وحيد القطعة بحجم 4,5 كيلو قاعدة، معظم أنواعه تنقل بالخنافس.

ط- الجنس Idaeovirus

يعد فايروس التقزم الشجيري لنبات الرازبري Rasoberry bushy dwarf virus (RBDV) هو النوع الممثل للجنس وهو جنس وحيد النوع، الفريون أيزومتري وحيد الجسيمة بقطر 33 نانومتر والجينوم مقسم داخلها إلى ثلاث قطع بحجم 5,5 و 2,2 و 1 كيلو قاعدة، يصيب فقط النباتات التي تعود لجنس الرازبري Rubus  وليس له ناقل بل ينقل بحبوب اللقاح والبذور.

ي- الجنس Ourmiavirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس بطيخ أورميا (Ourmia melon virus (OuMV ومنه اشتق اسم الجنس وأورميا هي منطقة في إيران حيث سجل الفايروس، الفريون مكون من ثلاث جسيمات باسيلية بأبعاد 62 و 46 و 37 × 18 نانومتر والجينوم موزع بينها بحجوم 2,9 و 1,1 و1 كيلو قاعدة على التوالي، ولم يسجل لها ناقل.

ك- الجنس Umbravirus

النوع الممثل للجنس هو فايروس تبرقش الجزر (Carrot mottle virus (CMOV وحيد الجسيمة مغلف بغلاف ليبيدي والجينوم وحيد القطعة بحجم 4 كيلو قاعدة، ليس لهذه الفايروسات قدرة تشفير غطاؤها البروتيني لذا تحتاج لإنجاز ذلك لفايروسات مساعدة من عائلة Luteoviridae وهي فايروسات ثابتة تنقل ميكانيكيا وبحشرات المن بمساعدة فايروس مساعد. يبين الشكل التالي مخططا تصنيفيا للعوائل والاجناس الفايروسية التي وردت في هذا الموضوع.

الشكل يوضح العوائل والاجناس الفايروسية المصنفة مع اشكالها الظاهرية.

الشكل مقتبس من Hull (2002).