بينت التحليلات المفصلة بأن هنالك دقائق في صميم النيوكليوسوم nucleosome Core particles والتي تبين بأنها تحتوي على 146 bp من الـ DNA ملتف 1.75 مرة حول صميم الهستون histone core ويتألف من جزيئتان من كل من H2A و H2B و H3 و H4( الهستونات الصميمية core histones) . بقي النوع الخامس من الهستونات والذي هو عبارة عن جزيئة واحدة وهي H1 والذي يرتبط بمدخل ومخرج النيوكليوسوم الصميمي. إن هذا يكون وحدة كروماتين ثانوية تدعى بالـ chromatosome والتي تتألف من 166 bpمن الـ DNA ملتفة حول الهستونات الصميمية وتحمل في مكانها بواسطة هستون H1 والذي يسمى بالهستون الرابط linker histone (شكل 1). نتجت عملية تعبئة الـ DNA بالهستونات ليف كروماتيني بقطر 10-nm والذي يتألف من الـ chromatosome مفصولة بقطع الـ DNA الرابط linker DNA segments. إن تعبئة الـ DNA إلى ليف كروماتيني بقطر 10nm يقصر طوله بمعدل ستة مرات. ويمكن للكروماتين أن يتكثف لأكثر من ذلك، وذلك بواسطة التفاف coiling ستة نيوكليوسومات إلى ليف بطول 30-nm.

يلعب التداخل الحادث بين جزيئات الهستون H1 مع النيوكليوسومات المجاورة دورا مهما في مراحل تكثف الكروماتين. يلاحظ من هذا إن عملية التكثف الحاصلة في الكروماتين تستغل كون إن الهستون H1 هو أقل الهستونات إحكاماً في ارتباطه بالكروماتين، لذا من السهولة إزالته بعد ارتباطه، ومن هنا دخل دور هذا الهستون في عملية التكثف. أما آلية عمل الهستون H1 فهي آلية تعتمد على إضافة وإزالة مجاميع الفوسفات hyper-hypo phosphrylation إلى الهستون H1 ، فعلى سبيل المثال، عندما تضاف مجموعة فوسفات إلى الهستون H1 فانه ينفك عن مكانه مؤديا إلى تقليل تكثف الكروماتين، والعكس بالعكس.

تتألف كل جزيئة نيوكليوسوم صميمية من معقد من 8 من البروتينات الهستونية - جزيئتان من كل من H2A و H2B و H3 و -H4 وحلزون DNA مزدوج والذي يكون بطول 146 زوج نيوكليوتيدي. يكون الهستون الثماني histone octamer بروتين صميمي والذي تلتف حوله جزيئة الـ DNA مزدوجة الشريط . تنفصل كل جزيئة نيوكليوسوم صميمية عن الجزيئة اللاحقة بمنطقة الـ DNA الرابط، والذي يتنوع في الطول من عدة نيوكليوتيدات قليلة إلى 80 نيوكليوتيدة. (يشير مصطلح nucleosome تقنيا إلى جزيئة النيوكليوسوم الصميمية nucleosome core particle زائدا جزيئة الهستون H1 زائداً واحدة من جزيئات الـ DNA الرابطة linker DNA) (شكل2  ).

تم التوصل في سنة 1997 إلى التركيب الجزيئي لجزيئة النيوكليوسوم الصميمية والتي تتألف من صميم هستوني histone coreيشبه اقرص يلتف حوله الـ DNA بإحكام ويصنع تقريباً لفة ونصف باتجاه اليسار. إن كل الهستونات الأربع التي تؤلف صميم النيوكليوسوم تمتاز بأنها بروتينات صغيرة نسبياً ( مئة ونيف من الأحماض الأمينية).