إن كروماتوغرافيا الغاز هي الاختيار الأفضل لتحليل المواد العضوية التي لها درجة غليان أقل من 250م وكذلك لتحليل الغازات الثابتة وهذه المجموعات لها ضغط بخاري عال، لذا فهي تحمل في الوسط الغازي المتحرك. وعند فصل المركبات ذات درجات الغليان العالية فإن بعض المركبات قد تتحلل داخل العمود عند درجات حرارة معينة إذا ما أريد الحصول على الكروماتوغرام في وقت معقول. أحياناً ما يكون التفكك الحراري مطلوباً قبل عملية الفصل، وهذا ما يحدث في الـ Pyrolysis MC ، فإن العينة يتم تفكيكها عند درجات حرارة عالية، ويتم بعدها فصل المكونات الناتجة داخل العمود والمنحنيات الناتجة من المواد المتفككة تكون دليلاً أكيداً على وجود بعض المكونات في العينة، لذا يستخدم Pyrolysis GC في مقارنة عينات مثل عينات الدهان والأجزاء الثقيلة من الزيت الخام أو المواد البلاستيكية. وتُعَدُّ هذه التقنية ضرورية في حالة عدم استجابة المقدر لمكونات العينة الأصلية، حيث يعمل التسخين على تفكك العينة والحصول على مكونات جديدة يستجيب لها المقدر.

كما أنه يمكن الاستفادة من زيادة درجة الحرارة لتحسين كفاءة العمود، إذ بالإمكان أيضًا تبريد العمود ليؤثر في فصل المواد ذات درجات الغليان المنخفضة مثل الميثان أو الهيدروجين، وفي حالة هذه المواد يمكن تشغيل الكروماتوغرافيا بسهولة تحت ظروف تتراوح بين درجة الحرارة العادية وبين درجة تجمد الثلج الجاف (0 إلى - 80 ^ο م).

وقد يتم عمل بعض التفاعلات على المجموعات الكيميائية التي تعطي ضغطاً بخاريًا منخفضا (درجات غليان عالية من أجل إنتاج مركب يمكن تبخيره بسهولة مثل حامض هيكسانوك C5H COOH) (Hexanoic Acid) ودرجة غليانه (^ο187م). فإذا تم تحويله إلى أيستر الميثيل (CHCOCH) درجة غليــانــه (^ο127م)، والاشتقاق (Derivatization) يصلح أحياناً من أجل الحصول على مجموعات كيميائية يستجيب لها الكشاف بقوة، كما في حالة إضافة (CCI) عند استعمال الكشاف الآسر للإلكترون (Electron capture detector) الذي يُعدُّ حساسا جداً للهالوجينات. ويجب حقن كمية معينة من العينة بحيث لا يحمل العمود فوق طاقته، ومن ثُمَّ لن تتم عملية الفصل. وعادة ما يستخدم حاقن خاص يقوم بتقليل حجم العينة التي تدخل إلى العمود الشعري، ويسمى هذا الحاقن الموزع (Splitter)، ويمكن أيضاً استخدام switching sample loop) بحيث تستخدم الصمامات الدائرية.