أما المستنقعات فهي أراض منخفضة تغمرها مياه ضحلة طوال العام أو في خلال جزء منه على الأقل، وتعيش بها بعض النباتات المحبة للماء. وهي كالبحيرات تكثر في المناطق الرطبة ويرجع السبب في نشأتها إلى عدد من العوامل أهمها: ردم بعض البحيرات، وغمر مياه الفيضان لبعض الأراضي المنخفضة المحاذية للشاطئ. وتتكون المستنقعات أحياناً نتيجة تجمع المياه في المناطق المنخفضة عقب سقوط الأمطار الغزيرة. أما في المناطق القطبية فيؤدي ذوبان الجليد خلال الصيف إلى تكون المستنقعات .

تتكون السبخات في المناطق الجافة بدلاً من المستنقعات. وتختلف عن المستنقعات من حيث ملوحة مياهها وسرعة جفافها. وهي : تتكون عادة عقب سقوط الأمطار، إذ تتجمع المياه في بعض الأماكن المنخفضة مكونة سبخات مالحة. وتتكون السبخات في المناطق الساحلية بسبب غمر مياه البحر أثناء عملية المد لبعض الأماكن المنخفضة القريبة من الساحل. وتتكون السبخات في بعض الأحيان الأخرى نتيجة تسرب مياه البحر عبر طبقات جيولوجية ذات تربة شديدة النفاذية، لتظهر في بعض الأماكن المنخفضة القريبة من الساحل كسبخة أبو ظبي وسبخة عجمان في دولة الإمارات العربية المتحدة.