من المعروف أن ارتفاع درجة الحرارة بشدة قبل تفتح الأزهار بنحو 13-17 يوما يؤدي إلى انخفاض حيوية حبوب اللقاح المتكونة ، وقلة عقد الثمار. ويؤدي ارتفاع درجة الحرارة إلى 34-37°م خاصة عندما يكون ذلك مصحوبا بانخفاض في الرطوبة النسبية إلى زيادة النتح، ونقص المستوى الرطوبي في النبات، وسقوط الأزهار والثمار الحديثة العقد. كما تؤدى الحرارة المرتفعة مع الإضاءة الضعيفة - وهي الظروف التي تكون سائدة في الأقبية البلاستيكية - إلى سقوط الأزهار بدون عقد.

ويتراوح المجال الحراري الملائم لعقد ثمار الفلفل من 12-16 م. وتعد درجة الحرارة المنخفضة ليلا (10° أو 15.5 م) أفضل من درجة الحرارة المرتفعة ( 21 أو 27 م). وتنخفض درجة حرارة الليل المثلى لعقد الثمار مع تقدم النبات في العمر.