على الرغم من أن حجم ثمرة الفلفل صفة وراثية تختلف من صنف لآخر، إلا أنها ترتبط بشدة مع عدد البذور في الثمرة. وتتراوح قيمة هذا الارتباط من 0٫96 - 0٫99 سواء أكانت درجة الحرارة السائدة أثناء نمو الثمار مرتفعة، أم منخفضة. هذا .. وتقل الزيادة في وزن الثمرة - مقابل كل بذرة إضافية - مع زيادة عدد البذور فيها.

وتأخذ ثمار الفلفل الشكل المميز للصنف عندما تسود الجو حرارة معتدلة تتراوح من 18-20م أثناء وبعد تفتح الأزهار . ويزداد طول ثمار الأصناف الحلوة إذا سادت الجو حرارة منخفضة تتراوح من 8-10 م بعد تفتح الأزهار.