الببتيدات Peptides

هي عبارة عن مركبات عضوية تتشكل من اتحاد حامضين أمينيين أو أكثر بروابط أميدية تسمى بالروابط الببتيدية (Peptide bonds)، وتتكون الروابط الببتيدية من تفاعل مجموعة ألفا – الكربوكيسل لأحد الأحماض الأمينية مع مجموعة ألفا – الأمين لحامض أميني آخر :

فالببتيد المتكون من حامضيين أمينيين يسمى : ثنائي الببتيد (Dipeptide)، والمتكون من ثلاثة أحماض أمينية يسمى ثلاثي الببتيد (Tripeptide)، والمتكون من أربعة أحماض امينية يسمى رباعي الببتيد (Tetra Peptide)، وهكذا. ولأجل تسهيل كتابة تراكيب المركبات الببتيدية، تستعمل رموز تتألف من ثلاثة حروف تعبر عن الحامض الاميني الداخل في تركيب الببتيد، يفصل الرمز الأول عن الثاني أما بواسطة نقطة او خط يفصل بين الرمز والآخر. وتبدأ قراءة اسم المركب الببتيدي من اليسار الى اليمين، فيكون الرمز الأول يعبر عن الحامض الاميني الذي يمثل الطرف الاميني في المركب الببتيدي اما الرمز الذي يقع على يمين الرمز الأول يمثل الحامض الثاني.

وهكذا الى ان نصل الى الحامض الأميني الاخير والذي يمثل الطرف الكربوكسيلي في المركب الببتيدي. واستناداً الى ذلك فإنه يمكن كتابة تراكيب الببتيدات التي تتكون من ثلاثة أحماض امينية مثل حامض الفالين والكلايسين والآلانين على هيئة الصورة التالية :

يمثل كل نوع من هذه المركبات مركباً مختلفاً ذا مجموعة خواص فيزيائية وكيميائية مميز عن النوع الآخر، ومع ذلك فإن الخواص الكيميائية تتشابه لهذه المركبات الى حد ما بسبب وجود نفس المجاميع الفعالة في الأنواع الستة المشار إليها في أعلاه. ان لكل هذه الأنواع الستة أحماض امينية تحتل الموقع الأول (الطرف الأميني) وأحماض اخرى تمثل الموقع الأخير (الطرف الكربوكسيلي) ويمكننا كتابة معادلة عامة تعبر عن الصيغة الجزيئية لأي ببتيد متعدد، وكما هو موضح في الشكل التالي:

حيث يعبر المرز (n) عن عدد الروابط الببتيدية الموجودة في الببتيد وهي من (رقم  2 فما فوق). نلاحظ من التركيب العام للجزيئات الببتيدية ان المركب الببتيدي يتكون دائماً من جزء يتكرر بانتظام في جميع المركبات الببتيدية والجزيئات البروتينية ويسمى بالسلسلة الرئيسية (او العمود الفقري للهيكل البنائي للببتيد المتعدد) وجزء آخر متغير ممثلا بالسلاسل الجانبية المتميزة والتي تحدد الصفات الفيزيائية والكيميائية العامة للجزيئات البروتينية المختلفة والموجودة في الكائنات الحية من حيوان ونبات وكائنات مجهرية، ويمكنننا التعبير عن ذلك في المقطع العام من جزيئة بروتينية :

الرموز R1 و R2 و R3 و R4 تعبر عن السلاسل الجانبية المتميزة للأحماض الامينية الداخلة في التركيب البنائي للجزيئة البروتينية، اما بقية التركيب فيمثل السلسلة الرئيسية للجزيئة البروتينية.

ليس هنالك اتفاق عام وأكيد على تعريف وتحديد عدد الوحدات التي تمثل المركب الببتيدي، او عدد الوحدات التي تمثل المركب البروتيني (الببتيد المتعدد). ومن أي عدد من الوحدات ننتقل بالتسمية من ببتيد الى بروتين. لكن يبدو ان العدد عشرة يمكن اعتباره العدد المناسب لوحدات المركبات الببتيدية وبعد الرقم عشرة ننتقل بالتسمية الى الببتيد المتعدد (Polypeptide). ان تسمية  المركبات الببتيدية يمكن تلخيصها باستبدال المقطع (ين، ine) للحامض الأميني الذي يمثل الطرف الأميني في المركب الببتيدي بالمقطع (يال، yl) فمثلا الببتيد الثنائي المكون من حامض الكلايسين والسيرين يمن تسميته  (glycl – seine).

ان السلسلة الرئيسية في المركبات الببتيدية يمكن ان تكون على هيئة سلسلة طويلة مفتوحة ذات نهايتين، تكون النهائية الأولى في أقصى يسار السلسلة، وتسمى بالطرف الاميني، والاخرى تكون في أقصى اليمين من السلسلة، وتسمى بالطرف الكربوكسيلي. كما يمكن ان تتواجد المركبات الببتيدية على هيئة أشكال حلقية، وهنالك عدد ليس بالقليل من المركبات الببتيدية الطبيعية لها أشكال حلقية، والسائد في المركبات الببتيدية هي التراكيب المفتوحة.