تحديد التوالي بالتشظية Shotgun Sequencing

تحديد توالي القطع الكبيرة من الجينوم او الجينومات الكاملة الكبيرة والكروموسومات ، وتتم باستعمال طريقة التشظية اذ تجزأ جزيئات DNA الكبيرة ثم يتم تحديد التوالي لكل قطعة لإنتاج المقروءات Reads التي تمتد توالياتها باتجاهين لإعطاء Mate Pairs هي المقروءة Read ، ونهاية المقروءات End Read تجمع في صف طويل من المتجاورات وتستعمل برامج حاسوب ملائمة لتجمعها كما موضح في المثال:

وبالجمع يمكن الحصول على التوالي الأصلي. وقد كانت الطريقة هي المفضلة لعقد من الزمن 1995-2005 ولكن تم تطويرها الى طرق أخرى مثل Next Generation Sequencing وتغطي 25-500 قاعدة وهي سريعة وتعطي تغطية جيدة للتوالي وفي وقت قصير ولكن الدقة ليست بالعالية.

وتعاني طريقة التشظية من قلة الدقة عند وجود المكررات المتشابهة ولكن يعتقد ان تطور برامج الحاسوب يمكن ان تتجاوز هذه المشكلة. وقد طبقت طريقة التشظية عام 1995 لتحديد توالي البكتريا Haemophilus influenzae وأصبحت الطريقة القياسية لتحديد توالي بدائيات النواة وتستعمل بنجاح مع تواليات حقيقيات النواة.