المرجع الالكتروني للمعلوماتية
المرجع الألكتروني للمعلوماتية

علم الاحياء
عدد المواضيع في هذا القسم 10456 موضوعاً
النبات
الحيوان
الأحياء المجهرية
علم الأمراض
التقانة الإحيائية
التقنية الحياتية النانوية
علم الأجنة
الأحياء الجزيئي
علم وظائف الأعضاء
المضادات الحيوية

Untitled Document
أبحث عن شيء أخر
تنفيذ وتقييم خطة إعادة الهيكلة (إعداد خطة إعادة الهيكلة1)
2024-11-05
مـعاييـر تحـسيـن الإنـتاجـيـة
2024-11-05
نـسـب الإنـتاجـيـة والغـرض مـنها
2024-11-05
المـقيـاس الكـلـي للإنتاجـيـة
2024-11-05
الإدارة بـمؤشـرات الإنـتاجـيـة (مـبادئ الإنـتـاجـيـة)
2024-11-05
زكاة الفطرة
2024-11-05

Reduction Order
8-2-2022
تنبّؤ يعقوب (عليه السلام)
27-01-2015
الرّجوع
25-03-2015
شجرة البان Moringa oleifera Lam
5-2-2021
الفيروسات التي تصيب الورد
26-6-2018
Direct object
2-2-2022

Terminal Proteins Enable Initiation at the Ends of Viral DNAs  
  
2116   04:36 مساءً   date: 7-4-2021
Author : JOCELYN E. KREBS, ELLIOTT S. GOLDSTEIN and STEPHEN T. KILPATRICK
Book or Source : LEWIN’S GENES XII
Page and Part :


Read More
Date: 16-5-2016 1963
Date: 1-5-2016 1905
Date: 21-11-2020 1899

Terminal Proteins Enable Initiation at the Ends of Viral DNAs


KEY CONCEPT
- A terminal protein binds to the 5′ end of DNA and provides a cytidine nucleotide with a 3′–OH end that primes replication.

An example of initiation at a linear end is provided by adenovirus and Ф29 DNAs, which actually replicate from both ends using the mechanism of strand displacement illustrated in FIGURE 1. The same events can occur independently at either end. Synthesis of a new strand starts at one end, displacing the homologous strand that was previously paired in the duplex. When the replication fork reaches the other end of the molecule, the displaced strand is released as a free single strand. It is then replicated independently; this requires the formation of a duplex origin by base pairing between some short complementary sequences at the ends of the molecule.

FIGURE 1. Adenovirus DNA replication is initiated separately at the two ends of the molecule and proceeds by strand displacement.
In several viruses that use such mechanisms, a protein is found covalently attached to each 5′ end. In the case of adenovirus, a terminal protein is linked to the mature viral DNA via a phosphodiester bond to serine, as indicated in FIGURE 2..


FIGURE 2. The 5′ terminal phosphate at each end of adenovirus DNA is covalently linked to serine in the 55-kD Ad-binding protein.
How does the attachment of the protein overcome the initiation problem? The terminal protein has a dual role: It carries a cytidine nucleotide that provides the primer –OH, and it is associated with DNA polymerase. In fact, linkage of terminal protein to a nucleotide is undertaken by DNA polymerase in the presence of adenovirus DNA. This suggests the model illustrated in FIGURE 3. The complex of polymerase and terminal protein, bearing the priming C nucleotide, binds to the end of the adenovirus DNA. The free 3′–OH end of the C nucleotide is used to prime the elongation reaction by the DNA polymerase. This generates a new strand whose 5′ end is covalently linked to the initiating C nucleotide. (The reaction actually involves displacement of protein from DNA rather than binding de novo. The 5′ end of adenovirus DNA is bound to the terminal protein that was used in the previous replication cycle. The old terminal protein is displaced by the new terminal protein for each new replication cycle.)


FIGURE 3. Adenovirus terminal protein binds to the 5′ end of DNA and provides a C–OH end to prime synthesis of a new DNA strand.
Terminal protein binds to the region located between 9 and 18 bp from the end of the DNA. The adjacent region, between positions 17 and 48, is essential for the binding of a host protein, nuclear factor I, which is also required for the initiation reaction. The initiation complex may therefore form between positions 9 and 48, a fixed distance from the end of the DNA.




علم الأحياء المجهرية هو العلم الذي يختص بدراسة الأحياء الدقيقة من حيث الحجم والتي لا يمكن مشاهدتها بالعين المجرَّدة. اذ يتعامل مع الأشكال المجهرية من حيث طرق تكاثرها، ووظائف أجزائها ومكوناتها المختلفة، دورها في الطبيعة، والعلاقة المفيدة أو الضارة مع الكائنات الحية - ومنها الإنسان بشكل خاص - كما يدرس استعمالات هذه الكائنات في الصناعة والعلم. وتنقسم هذه الكائنات الدقيقة إلى: بكتيريا وفيروسات وفطريات وطفيليات.



يقوم علم الأحياء الجزيئي بدراسة الأحياء على المستوى الجزيئي، لذلك فهو يتداخل مع كلا من علم الأحياء والكيمياء وبشكل خاص مع علم الكيمياء الحيوية وعلم الوراثة في عدة مناطق وتخصصات. يهتم علم الاحياء الجزيئي بدراسة مختلف العلاقات المتبادلة بين كافة الأنظمة الخلوية وبخاصة العلاقات بين الدنا (DNA) والرنا (RNA) وعملية تصنيع البروتينات إضافة إلى آليات تنظيم هذه العملية وكافة العمليات الحيوية.



علم الوراثة هو أحد فروع علوم الحياة الحديثة الذي يبحث في أسباب التشابه والاختلاف في صفات الأجيال المتعاقبة من الأفراد التي ترتبط فيما بينها بصلة عضوية معينة كما يبحث فيما يؤدي اليه تلك الأسباب من نتائج مع إعطاء تفسير للمسببات ونتائجها. وعلى هذا الأساس فإن دراسة هذا العلم تتطلب الماماً واسعاً وقاعدة راسخة عميقة في شتى مجالات علوم الحياة كعلم الخلية وعلم الهيأة وعلم الأجنة وعلم البيئة والتصنيف والزراعة والطب وعلم البكتريا.