علم الكيمياء
تاريخ الكيمياء والعلماء المشاهير
التحاضير والتجارب الكيميائية
المخاطر والوقاية في الكيمياء
اخرى
مقالات متنوعة في علم الكيمياء
كيمياء عامة
الكيمياء التحليلية
مواضيع عامة في الكيمياء التحليلية
التحليل النوعي والكمي
التحليل الآلي (الطيفي)
طرق الفصل والتنقية
الكيمياء الحياتية
مواضيع عامة في الكيمياء الحياتية
الكاربوهيدرات
الاحماض الامينية والبروتينات
الانزيمات
الدهون
الاحماض النووية
الفيتامينات والمرافقات الانزيمية
الهرمونات
الكيمياء العضوية
مواضيع عامة في الكيمياء العضوية
الهايدروكاربونات
المركبات الوسطية وميكانيكيات التفاعلات العضوية
التشخيص العضوي
تجارب وتفاعلات في الكيمياء العضوية
الكيمياء الفيزيائية
مواضيع عامة في الكيمياء الفيزيائية
الكيمياء الحرارية
حركية التفاعلات الكيميائية
الكيمياء الكهربائية
الكيمياء اللاعضوية
مواضيع عامة في الكيمياء اللاعضوية
الجدول الدوري وخواص العناصر
نظريات التآصر الكيميائي
كيمياء العناصر الانتقالية ومركباتها المعقدة
مواضيع اخرى في الكيمياء
كيمياء النانو
الكيمياء السريرية
الكيمياء الطبية والدوائية
كيمياء الاغذية والنواتج الطبيعية
الكيمياء الجنائية
الكيمياء الصناعية
البترو كيمياويات
الكيمياء الخضراء
كيمياء البيئة
كيمياء البوليمرات
مواضيع عامة في الكيمياء الصناعية
الكيمياء الاشعاعية والنووية
تسمح معرفة المدى والأطوار بوضع خريطة لكثافة الإلكترونات
المؤلف:
د. روبرت موراي وآخرون
المصدر:
هاربرز في الكيمياء الحيوية
الجزء والصفحة:
ص 162
12-5-2021
1695
تسمح معرفة المدى والأطوار بوضع خريطة لكثافة الإلكترونات
هناك ثلاثة معالم تميز كل حزمة متعرجة وهي المدى (Amplitude) والطول الموجي (Wavelength) والطور (Phase)، والأخير هو الوحيد الذي يكون مجهولا. ويقوم حل مشكلة الطور عموماً على استبدال متشاكل متعدد Multiple) (isomorphous replacement بحيث يدخل معدن ثقيل أو بين أخر مميز سلفا إما بالتبلور المتزامن (Co-crystallization) أو بالانتشار في البلورة الموجودة نحلل بعد ذلك التغيرات في نموذج الانعراج لتحديد الأطوار بعمليات رياضية تشمل وضع خرائط باترسون (Patterson maps). وتستخدم الأطوار والمدى لحساب خريطة كثافة الإلكترونات للوحدة المتكررة من البلورة.
وتمثل خرائط كثافة الإلكترونات سلسلة من المقاطع المتوازية عبر البروتين ممثل فيها خطوط الكفاف (Contour lines) القريبة من بعضها بعضاً مناطق التغير الكبير في كثافة الإلكترونات. وتماثل خرائط كثافة الإلكترونات الخرائط الطبغرافية التي ممثل فيها خطوط الكفاف القريبة بعضها من بعض مناطق يتغير فيها الارتفاع بشكل حاد. ولقد استخدمت مخزونات. خرائط كثافة الإلكترونات المرسومة على مادة شفافة لتقليد خريطة كثافة الإلكترونات ثلاثية الأبعاد التي أنشئ منها اجتهاداً النموذج الفيزيائي للسلسلة الرئيسية من البروتين بشكل اجتهادي. ولكن التحليل البنيوي المعاصر يستخدم الحواسيب التي تعرض خرائط كثافة الإلكترونات بكفاف ثلاثي الأبعاد بحيث يعكن مطابقتها بالعين مع البنية الأولية المعروفة للبروتين (الشكل 6-12)
شكل 6-12 : تمثيل لكيفية تطابق بنية أولية معروفة مع نموذج الكثافة الإلكترونية. وتلاحظ الكثافة الإلكترونية للطاق بيتا من النصف الانتهائي الأميني للـ RbsA، وهو الشريط الرابط للآتب (ATP) للناقلة ABC للريبوز من الإشريكية القولونية.
جاهزية الاستعداد لشهر رمضان
إستعراض موجز لحياة السيدة زينب الكبرى
أم البنين .. صانعة الوفاء وراعية الفضيلة
